Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX40Q8IX18 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX40Q8IX18 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX40Q8IX18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DHX40Q8IX18 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms