Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC8AQ8IWT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC8AQ8IWT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC8AQ8IWT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC8AQ8IWT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms