Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC103Q8IW40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC103Q8IW40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC103Q8IW40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms