Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGRP3Q8IV61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP3Q8IV61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms