Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLD3Q8IV08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLD3Q8IV08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLD3Q8IV08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms