Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAINQ86UA6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAINQ86UA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPAINQ86UA6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms