Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6BQ86SZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC6BQ86SZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms