Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
LRRC9Q6ZRR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
LRRC9Q6ZRR7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LRRC9Q6ZRR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms