Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC137Q6PK04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC137Q6PK04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC137Q6PK04 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms