Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF613Q6PF04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF613Q6PF04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF613Q6PF04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF613Q6PF04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms