Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDD2Q6NTF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHBDD2Q6NTF9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDD2Q6NTF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms