Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGB2Q6NT52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGB2Q6NT52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms