Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC70Q6NSX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC70Q6NSX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms