Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP8Q6NSW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms