Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM225Q6GV28 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225Q6GV28 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225Q6GV28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM225Q6GV28 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms