Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LARP1BQ659C4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LARP1BQ659C4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1BQ659C4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1BQ659C4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LARP1BQ659C4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms