Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC23Q5W5X9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC23Q5W5X9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC23Q5W5X9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.5 ms