Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
MYOM3Q5VTT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
MYOM3Q5VTT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
MYOM3Q5VTT5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYOM3Q5VTT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
MYOM3Q5VTT5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MYOM3Q5VTT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms