Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM27D1Q5T7N8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM27D1Q5T7N8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM27D1Q5T7N8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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