Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWT1Q5T5J6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SWT1Q5T5J6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms