Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C10orf55Q5SWW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C10orf55Q5SWW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C10orf55Q5SWW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C10orf55Q5SWW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C10orf55Q5SWW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms