Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIA3Q5JRA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MIA3Q5JRA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
MIA3Q5JRA6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIA3Q5JRA6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms