Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1JQ5JR12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1JQ5JR12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms