Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf48Q5BLP8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C4orf48Q5BLP8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C4orf48Q5BLP8 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C4orf48Q5BLP8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf48Q5BLP8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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