Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A3Q495N2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC36A3Q495N2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms