Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC153Q494R4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC153Q494R4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms