Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC6LQ2NKX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC6LQ2NKX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6LQ2NKX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms