Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q1T7F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q1T7F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q1T7F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q1T7F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q1T7F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q1T7F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q1T7F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q1T7F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q1T7F1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q1T7F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q1T7F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q1T7F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q1T7F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q1T7F1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q1T7F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q1T7F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q1T7F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q1T7F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q1T7F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q1T7F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q1T7F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q1T7F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q1T7F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q1T7F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q1T7F1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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