Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSPP1Q1MSJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSPP1Q1MSJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
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