Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF1Q17RB8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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LONRF1Q17RB8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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LONRF1Q17RB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF1Q17RB8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
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LONRF1Q17RB8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF1Q17RB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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