Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPP1Q16831 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPP1Q16831 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms