Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCK2Q16822 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCK2Q16822 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms