Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLPPQ16740 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLPPQ16740 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLPPQ16740 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms