Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMN1Q16637 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMN1Q16637 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMN1Q16637 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms