Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA3Q16281 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGA3Q16281 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA3Q16281 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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