Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC6Q16204 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC6Q16204 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC6Q16204 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC6Q16204 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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