Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHRNA2Q15822 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHRNA2Q15822 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHRNA2Q15822 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CHRNA2Q15822 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms