Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SKIV2LQ15477 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SKIV2LQ15477 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKIV2LQ15477 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms