Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPCS2Q15005 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPCS2Q15005 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPCS2Q15005 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPCS2Q15005 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPCS2Q15005 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPCS2Q15005 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPCS2Q15005 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms