Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRF3Q14653 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF3Q14653 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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