Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL9A2Q14055 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL9A2Q14055 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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