Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTCH1Q13635 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTCH1Q13635 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTCH1Q13635 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTCH1Q13635 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PTCH1Q13635 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
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