Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNASE1L3Q13609 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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DNASE1L3Q13609 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNASE1L3Q13609 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNASE1L3Q13609 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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