Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRR1Q13601 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRR1Q13601 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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