Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTM1Q13496 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTM1Q13496 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTM1Q13496 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTM1Q13496 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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