Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL49Q13405 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL49Q13405 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL49Q13405 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
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