Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P3Q13401 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS2P3Q13401 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P3Q13401 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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