Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN3Q13286 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN3Q13286 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN3Q13286 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN3Q13286 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms