Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRSF5Q13243 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF5Q13243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRSF5Q13243 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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