Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3BQ13214 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3BQ13214 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3BQ13214 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3BQ13214 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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